Teisinis pagrindas kariniam bendradarbiavimui. 2025 m. birželio 30 d. Maniloje pasirašytas susitarimas dėl bendradarbiavimo gynybos srityje.
Karinis diplomatinis atstovavimas. Lietuvą regione atstovauja gynybos patarėjas reziduojantis Japonijoje.
Dvišalis karinis bendradarbiavimas. Šiuo metu siekiama identifikuoti konkrečius bendradarbiavimo prioritetus, vyksta kasmetiniai saugumo pokalbiai. 2025 m. rudenį Lietuvoje lankėsi du Filipinų gynybos sekretoriaus pavaduotojai atsakingi už gynybos politiką ir gynybos pramonę.