Ne, kvantiniai kompiuteriai skirtingas kriptografijos rūšis veikia nevienodai. Labiausiai pažeidžiama yra asimetrinė kriptografija, tokia kaip RSA, ECDSA, ECDH, DH ir ECC, nes ji paremta viešojo ir privataus rakto pora. Turint pakankamai galingą kvantinį kompiuterį, iš viešojo rakto būtų galima atkurti privatų raktą, todėl ši kriptografijos rūšis laikoma nesaugia kvantinių kompiuterių atžvilgiu.
Tuo tarpu simetriniai šifrai (pvz., AES) ir maišos funkcijos (pvz., SHA-2, SHA-3) laikomi atspariais net ir kvantiniams kompiuteriams, jei naudojami ilgesni raktai ar išvestys (pvz., AES-256 arba ≥256 bitų išvestis, kompensuojanti Groverio algoritmo efektą). Kvantiniai kompiuteriai gali juos susilpninti tik iš dalies, todėl pakanka naudoti ilgesnius raktus ar išvestis, kad būtų išlaikytas saugumo lygis.