Reaguodami į 2016 m. rugsėjo 14 d. Valstybės kontrolieriaus pasisakymą, kad Krašto apsaugos ministerijos (KAM) komandiruočių pirkimai vyksta be viešųjų pirkimų konkurso, informuojame, jog ankstesnio Valstybės kontrolės audito metu nustatyta, kad 2009 m. KAM nesilaikė Viešųjų pirkimo įstatyme nustatytų viešųjų pirkimų procedūrų komandiruočių pirkime. Ministerija, įgyvendindama pateiktą rekomendaciją dėl viešųjų pirkimo procedūrų vykdymo, atliko komandiruotėms būtinų paslaugų viešųjų pirkimų procedūras. 2011 m. balandžio 15 d. sudarė keleivių pervežimo oro transportu ir su tuo susijusių paslaugų pirkimo-pardavimo sutartį su paslaugos teikėja – uždarąja akcine bendrove, tačiau 2011 m. birželio 23 d. buvo priversta ją nutraukti, nes paslaugos teikėja pažeidinėjo sutarties nuostatas, siūlydama bilietų ir maršrutų kainas žymiai didesnes nei numatyta sutartyje. Paslaugos teikėja padavė KAM į teismą dėl sutarties nutraukimo, bet teisme KAM laimėjo.
Šiuo metu kelionių bilietus komandiruotėms KAM perka į komandiruotes vykstantys fiziniai asmenys apklausę ne mažiau nei tris tiekėjus ir išsirenka tinkamiausią variantą. Kelionės išlaidos jiems būna kompensuojamos, vadovaujantis Lietuvos Respublikos Vyriausybės 2004 m. balandžio 29 d. nutarimu Nr. 526 „Dėl tarnybinių komandiruočių išlaidų apmokėjimo biudžetinėse įstaigose taisyklių patvirtinimo“.
Krašto apsaugos sistema – tai ne vien ministerija
Kalbant apie Krašto apsaugos sistemą (KAS) į komandiruotes asmenis siunčia KAM, jai pavaldžios įstaigos (pvz., Lietuvos karo akademija, Nacionalinis kibernetinio saugumo centras, Vytauto Didžiojo karo muziejus, Mobilizacijos ir pilietinio pasipriešinimo departamentas, Antrasis operatyvinių tarnybų departamentas, kt.) ir Lietuvos kariuomenė. Didžiausią komandiruočių dalį KAS sudaro Lietuvos kariuomenės komandiruotės. Jų didžiąją dalį sudaro pratybos, mokymai, pasirengimai misijoms. Pvz., 2016 pirmąjį ketvirtį KAS komandiruotėms išleista 791 180 Eur, iš jų KAM – 64 000 EUR. Komandiruočių lėšos apima išlaidas kelionei, apgyvendinimui, teisės aktų nustatyta tvarka mokamiems dienpinigiams.
Pagal patvirtintą komandiruotės apibrėžimą, kiekvienas išvykimas į užsienį, išskyrus dalyvavimą tarptautinėse operacijose, yra komandiruotė. Krašto apsaugos sistemoje pratybos sudaro labai didelę dalį tarptautinės veiklos. Pavyzdžiui, kai kuopa (šimtas karių) ilgiau nei savaitei važiuoja į pratybas Jungtinėje Karalystėje, tai skaičiuojama kaip komandiruotė. Pastaraisiais metais pratybų, vykstančių užsienyje, skaičius ypač išaugo.
KAS kariai ir civiliai dažnai dalyvauja Europos Sąjungos, NATO ir kituose tarptautiniuose renginiuose ir institucijų veikloje. Tai ir aukšto lygio renginiai (ministrų, viceministrų, politikos direktorių susitikimai), įvairios NATO, ES ir kitų organizacijų darbo grupės, su Ukraina susiję projektai, tarptautiniai projektai, seminarai, teisiniai klausimai, pratybų planavimo konferencijos, kt. Nemaža dalis komandiruočių yra susiję su Lietuvos kariuomenės įsigijimais ginkluotės srityje. Darbiniai susitikimai ir derybos su partneriais ir karių mokymai, kurie naudosis technika. Augantys ginkluotės įsigijimai iš užsienio taip pat yra viena iš priežasčių, kodėl patiriamos didesnės komandiruočių išlaidos.
Krašto apsaugos ministerijoje laikomasi nuostatos vykti į komandiruotes tik esant būtinybei. Be to, taupant lėšas vis dažniau yra naudojamos vaizdo konferencijos, kai galima, vykstama automobiliu, o ne lėktuvu.