Gegužės 15 d. Lietuvos krašto apsaugos ministras Juozas Olekas Biškeke pasirašė Lietuvos ir Kirgizijos gynybos ministerijų susitarimą dėl dvišalio karinio bendradarbiavimo.
Sutartis numato bendradarbiavimą karinio mokymo srityje, apsikeitimą pažintiniais vizitais, specialistų konsultacijas ir kitas dvišalio bendradarbiavimo priemones.
Lietuva šių metų rugpjūčio mėnesį planuoja akredituoti gynybos atašė Kazachstanui ir Kirgizijai. Atašė turėtų reziduoti Kazachstane. Kirgizija Lietuvoje savo gynybos atašė nėra akreditavusi.
2004 m. Stambulo viršūnių susitikime NATO šalys nusprendė plėsti bendradarbiavimą su Centrine Azija. Kirgizija yra programos Partnerystė taikos labui narė ir siekia stiprinti bendradarbiavimą su NATO. Aljansas naudojasi Kirgizijos Manaso karine oro baze vykdydamas operaciją ISAF Afganistane.