Krašto apsaugos ministerija parengė Krašto apsaugos sistemos organizavimo ir karo tarnybos įstatymo pakeitimo projektą, kuriame numatyta įgyvendinti su krašto apsaugos sistemos valdymo tobulinimu susijusius struktūrinius pertvarkymus ir baigti Gynybos štabo integraciją į ministeriją.
Įstatymo pakeitimo projekte siūloma vietoj Gynybos štabo viršininko pareigybės įsteigti karinę Pajėgumų ir ginkluotės generalinio direktoriaus pareigybę. Pajėgumų ir ginkluotės generalinis direktorius butų atsakingas už karinių pajėgumų ir ginkluotės strateginį planavimą, pagal savo kompetenciją padėtų krašto apsaugos ministrui rengti krašto apsaugos sistemos plėtros planus ir valstybės karinę strategiją, o kariuomenės vadui – vykdyti strateginio lygmens vadovavimo kariuomenei (ginkluotosioms pajėgoms) funkcijas.
Įstatymo projekte taip pat siūloma kariuomenės Jungtiniam štabui perduoti dalį Gynybos štabo vykdytų funkcijų, susijusių su ginkluotos gynybos planų rengimu.
Tokiu būdu siekiama išgryninti ir vienoje institucijoje – integruotoje karių ir civilių ministerijoje – sukoncentruoti strateginio lygmens funkcijas, išvengiant jų dubliavimosi ir optimizuojant štabų personalo darbą.
Krašto apsaugos ministerijos pajėgumų ir ginkluotės generalinis direktorius būtų pavaldus krašto apsaugos ministrui ir atsakingas kariuomenės vadui, ministerijos valdymo struktūros hierarchijoje ši pareigybė būtų tame pačiame lygmenyje, kaip viceministrai ir ministerijos kancleris.
Tobulinant krašto apsaugos sistemos valdymą, atskiriami strateginis, operacinis ir taktinis vadovavimo lygiai ir apibrėžiamos šiems lygiams priskirtos funkcijos.
Strateginiame lygmenyje veikianti integruota civilinė-karinė ministerija yra atsakinga už saugumo ir gynybos politikos formavimą, karinių pajėgumų ir ginkluotės strateginį planavimą, programų ir biudžeto rengimą, išteklių valdymą, personalo ir įsigijimo politikos įgyvendinimą.
Operacinį vadovavimą užtikrinantis Jungtinis štabas atsakingas už jungtinių operacijų planavimą ir vykdymą, strateginiuose planuose numatytų uždavinių įgyvendinimą.
Taktiniame lygmenyje atskiros pajėgos ir jų padaliniai užtikrina kovinę parengtį, karinių vienetų aprūpinimą ir administravimą.