1993 m. spalio 22 d. tuometinis krašto apsaugos ministras Audrius Butkevičius pasirašė įsakymą Lietuvos Respublikos Ginkluotųjų pajėgų, Lauko Kariuomenės I-mos motodesantinės brigados „Geležinis Vilkas” Marijampolės motodesantiniam batalionui perimti Lietuvos Respublikos kariuomenės Didžiojo Lietuvos Kunigaikščio Vytenio devintojo pėstininkų pulko vardą, tradicijas, simboliką ir naudoti tai kartu su I-mos motodesantinės brigados „Geležinis Vilkas” ženklais.
Taip pat 1994 m. spalio 22-ąją tuometinis krašto apsaugos ministras Linas Linkevičius pasirašė aktą, kuriuo, siekdamas atgaivinti ir puoselėti Lietuvos kariuomenės tradicijas, Lietuvos didžiojo kunigaikščio Vytenio motorizuotajam pėstininkų batalionui vardo suteikimo metinių proga įteikė dalinio vėliavą.
Bataliono kovinė vėliava buvo atkurta pagal 9-tojo pėstininkų pulko vėliavą. Jos centre – Lietuvos Didžiojo kunigaikščio Vytenio portretas, apjuostas devyniakampe žvaigžde. Vėliavą taip pat puošia bataliono šūkiu tapęs istorinis užrašas „Amžiais už Vilnių dės galvą lietuvis”.
